Ricercatori cileni convalideranno la diagnosi con un singolo test per la scabbia polverulenta e la scabbia comune

Un team della Pontificia Università Cattolica del Cile (UC) ha ottenuto i finanziamenti FONDEF per trasformare SCAB-ID 2.0, un test qPCR multiplex che rileva e distingue gli agenti patogeni responsabili della scabbia polverulenta e della scabbia comune, in uno strumento standardizzato per i laboratori di diagnostica agricola.

La scabbia polverulenta e la scabbia comune sono tra le malattie delle imperfezioni tuberose più frequentemente confuse. Entrambe producono lesioni superficiali che peggiorano la qualità della pelle e i soli sintomi spesso non sono sufficienti per una diagnosi affidabile. Eppure gli organismi responsabili non sono correlati. La scabbia polverulenta è causata da Spongospora subterranea, un plasmodioforide obbligato trasmesso dal suolo. La scabbia comune è causata da un agente patogeno Streptomyces batteri, principalmente Streptomyces scabiei.

Questa distinzione ha conseguenze pratiche. Le due malattie reagiscono in modo opposto all'umidità del suolo: mantenere il terreno umido durante la fase di formazione dei tuberi è una misura standard contro la scabbia comune, ma le stesse condizioni favoriscono la scabbia polverulenta. Una diagnosi errata può quindi indurre gli agricoltori a gestire una malattia in modo da favorire l'altra.

Dal protocollo di dottorato allo strumento di laboratorio

Il progetto, con sede presso la Facoltà di Agronomia e Sistemi Naturali dell'Università di Cincinnati (UC), è stato selezionato nell'ambito del concorso IDeA Technology Research 2026, indetto da FONDEF, il programma di ricerca applicata dell'Agenzia Nazionale per la Ricerca e lo Sviluppo del Cile (ANID). È diretto da Stephanie Riquelme, laureata in biotecnologie vegetali presso l'UC. Marlene Rosales è la direttrice supplente e Sara Acevedo collabora come ricercatrice.

SCAB-ID 2.0 si basa su un protocollo sviluppato da Riquelme durante la sua ricerca di dottorato. Il test esegue una singola reazione qPCR multiplex che identifica quale dei due patogeni è presente in un campione di patata. La nuova fase mira a validarlo in condizioni operative, aggiungendo criteri di riproducibilità, controllo di qualità e tracciabilità, insieme a un pacchetto di trasferimento per supportarne l'adozione da parte di un laboratorio di diagnostica agricola.

Riquelme ha affermato che una diagnosi specifica permette di determinare con maggiore precisione quale agente sia presente in un campione e fornisce informazioni utili sia per la valutazione fitosanitaria sia per le decisioni relative alla produzione e alla gestione delle colture. L'obiettivo, ha aggiunto, è quello di disporre di uno strumento riproducibile in grado di rilevare e differenziare entrambi gli agenti simultaneamente nei campioni di patate.

Entità del finanziamento

I termini del bando ANID forniscono un'indicazione della portata del progetto. I finanziamenti previsti dal concorso IDeA Technology Research 2026 sono limitati a 237 milioni di CLP per progetto, per una durata massima di 24 mesi, e gli istituti beneficiari sono tenuti a cofinanziare almeno il 15% del contributo richiesto. I progetti dovranno realizzare un prototipo avanzato con un incremento misurabile della maturità tecnologica. L'importo assegnato a SCAB-ID 2.0 e l'identità del laboratorio che adotterà la tecnologia non sono stati resi noti.

Perché è importante per le patate da seme

Il team si aspetta diagnosi più accurate a supporto delle decisioni fitosanitarie, della valutazione e della separazione dei lotti e delle procedure di certificazione.

Il caso più eclatante si riscontra nella produzione di patate da seme. Non esiste un efficace controllo chimico contro la scabbia polverulenta e le spore quiescenti del patogeno possono sopravvivere nel terreno per molti anni. S. subterranea Trasmette anche il virus della maculatura fogliare della patata (PMTV), che causa necrosi interna nei tuberi. Poiché la principale linea di difesa consiste nell'impedire la diffusione del patogeno su terreni non contaminati, un'identificazione affidabile in laboratorio nella fase di selezione delle sementi ha un valore economico diretto.

Rimane aperta una questione riguardo alla scabbia comune. La malattia è causata da un gruppo di agenti patogeni Streptomyces specie, tra cui S. acidiscabies and S. turgidiscabies così come S.scabiei. La descrizione del progetto pubblicata nomina S.scabiei come agente principale, ma non specifica se il test rilevi anche le altre specie. Questo sarà un fattore importante per determinare quanto SCAB-ID 2.0 si rivelerà utile come strumento di certificazione.

Fonte: Pontificia Universidad Católica de Chile / Descrizione del progetto ANID